Créé en 1929 sous le nom deLaboratoires Beaufour, Ipsen est encore contrôlé par les descendants du fondateur Henri Beaufour, via la société de droit luxembourgeois Mayroy. Anne et Henri, deux des petits-enfants du fondateur, siègent au conseil d'administration, mais leur soeur Véronique ne prend plus part à la gestion du groupe. Malgré le récent désengagement de cette dernière, la famille Beaufour souhaite garder le contrôle, comme l'atteste le rachat par Mayroy de cette participation.
